Ganta è un liceale studioso ma irritabile e asociale, mal sopportato dai compagni di classe. Il suo cattivo atteggiamento, però, è figlio di una grave forma di insonnia, che spesso lo costringe a trascorrere notti intere senza un solo minuto di riposo. Per questo, è alla costante e disperata ricerca di un posto per isolarsi e strappare qualche ora di sonno. Mentre cerca asilo nell'osservatorio astronomico del suo liceo, un luogo abbandonato in seguito a eventi misteriosi, il giovane si imbatte in Isaki, compagna di scuola che al contrario di lui è molto popolare e benvoluta ma che, proprio come lui, pare poter dormire in pace solo in quell'aula. Dopo aver stabilito di condividere il loro piccolo rifugio, i due scopriranno di avere in comune molto di più che un mero disturbo del sonno. Il ritiro estivo dei due ragazzi sembra durare ora un attimo, ora un'eternità. In lacrime, Ganta confessa a Isaki la fonte dell'ansia che gli impedisce di dormire. Per tutta risposta, lei... Dopo giornate libere dalle costrizioni della vita reale, il viaggio alla volta del cielo stellato giunge al traguardo: le rovine di Mawaki...