Era l'anno 2199 D.C. Partita dalla Terra e diretta verso la Grande Nube di Magellano, la nave spaziale Yamato tenta, grazie a un motore a onde moventi, il primo test di curvatura nella storia dell'umanità. Tuttavia, durante la rotta, viene inaspettatamente risucchiata dalla forza di gravità di Giove. Dopo averne attraversato l'atmosfera, la nave Yamato si trova costretta a compiere un atterraggio di emergenza. E così che si ritrova su un continente di cui non si conosceva ancora l'esistenza e abitato da creature misteriose.