Anno 2199 L'umanità, ormai a un solo anno dall'estinzione, pone le proprie ultime speranze nella costruzione della corazzata spaziale Yamato. Inizia così il viaggio del capitano Okita e del suo equipaggio per raggiungere Iskandar, un pianeta lontano 168.000 anni luce nella Grande Nube di Magellano. Il generale Domer viene convocato direttamente dal leader supremo Dessler a Baleras, capitale imperiale di Garmillas, e gli viene ordinato di andare in missione punitiva contro la Yamato in cambio della vita. Nello stesso momento, Kodai e Mori decollano con un ricognitore tipo 100 per portare a termine un pattugliamento, ma le comunicazioni si interrompono all'improvviso. I due tornano indietro in tutta fretta ma non trovano nessuno sulla Yamato, che è intrappolata senza la possibilità di ripristinare il controllo della navigazione... Il sesto volume tratto dalla serie animata «Star Blazers 2199».